MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017819	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859011
2	NC_017819	T	7	7	29	35	0 %	100 %	0 %	0 %	386859011
3	NC_017819	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
4	NC_017819	TTA	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
5	NC_017819	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017819	TA	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017819	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017819	AACA	2	8	129	136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017819	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017819	TA	3	6	186	191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017819	AT	3	6	209	214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017819	TAAT	2	8	220	227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017819	TTAA	2	8	255	262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017819	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017819	CTA	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017819	ACT	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017819	TAAA	2	8	368	375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017819	CAAA	2	8	378	385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017819	TAT	2	6	400	405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017819	T	6	6	405	410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017819	TAA	2	6	429	434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017819	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	386859012
23	NC_017819	TTTA	2	8	453	460	25 %	75 %	0 %	0 %	386859012
24	NC_017819	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
25	NC_017819	TAT	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
26	NC_017819	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
27	NC_017819	TC	3	6	537	542	0 %	50 %	0 %	50 %	386859012
28	NC_017819	TAA	2	6	543	548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
29	NC_017819	TTA	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
30	NC_017819	TTTC	2	8	569	576	0 %	75 %	0 %	25 %	386859012
31	NC_017819	TAGAT	2	10	579	588	40 %	40 %	20 %	0 %	386859012
32	NC_017819	TTTC	2	8	604	611	0 %	75 %	0 %	25 %	386859012
33	NC_017819	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	386859012
34	NC_017819	TAT	2	6	701	706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
35	NC_017819	T	6	6	785	790	0 %	100 %	0 %	0 %	386859012
36	NC_017819	AAATA	2	10	825	834	80 %	20 %	0 %	0 %	386859012
37	NC_017819	CTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859012
38	NC_017819	ATT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
39	NC_017819	ATCA	2	8	935	942	50 %	25 %	0 %	25 %	386859013
40	NC_017819	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
41	NC_017819	T	8	8	1040	1047	0 %	100 %	0 %	0 %	386859013
42	NC_017819	T	6	6	1069	1074	0 %	100 %	0 %	0 %	386859013
43	NC_017819	CTC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859013
44	NC_017819	CTT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859013
45	NC_017819	ATA	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
46	NC_017819	TTA	2	6	1313	1318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
47	NC_017819	TTTC	2	8	1326	1333	0 %	75 %	0 %	25 %	386859013
48	NC_017819	ATT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
49	NC_017819	TAT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
50	NC_017819	TCC	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017819	GTT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017819	ATA	2	6	1540	1545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017819	A	6	6	1571	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
54	NC_017819	TTA	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
55	NC_017819	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	386859014
56	NC_017819	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859014
57	NC_017819	A	6	6	1623	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
58	NC_017819	GCTA	2	8	1636	1643	25 %	25 %	25 %	25 %	386859014
59	NC_017819	TCT	2	6	1658	1663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859014
60	NC_017819	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
61	NC_017819	A	6	6	1682	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
62	NC_017819	TTTC	2	8	1689	1696	0 %	75 %	0 %	25 %	386859014
63	NC_017819	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
64	NC_017819	TAT	3	9	1728	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
65	NC_017819	TAG	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859014
66	NC_017819	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
67	NC_017819	TAA	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
68	NC_017819	ACT	3	9	1858	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
69	NC_017819	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
70	NC_017819	TAATA	2	10	1912	1921	60 %	40 %	0 %	0 %	386859014
71	NC_017819	TCTAT	2	10	1979	1988	20 %	60 %	0 %	20 %	386859014
72	NC_017819	CAT	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
73	NC_017819	ATT	2	6	2074	2079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
74	NC_017819	T	6	6	2078	2083	0 %	100 %	0 %	0 %	386859014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.